The Unknome：研究人員剛剛創(chuàng)建了一個(gè)我們最神秘基因的數(shù)據(jù)庫(kù)

為了增加我們對(duì)基因藍(lán)圖的理解，研究人員建立了一個(gè)我們幾乎一無(wú)所知的基因數(shù)據(jù)庫(kù)。

雖然我們知道這些基因存在并編碼蛋白質(zhì)，但我們不知道它們的用途。

“很明顯，科學(xué)研究?jī)A向于關(guān)注經(jīng)過(guò)充分研究的蛋白質(zhì)，導(dǎo)致人們擔(dān)心知之甚少的基因被不合理地忽視，”研究者來(lái)自英國(guó)MRC分子生物學(xué)實(shí)驗(yàn)室（LMB）的解釋。

“為了解決這個(gè)問(wèn)題，我們開(kāi)發(fā)了一個(gè)公開(kāi)可用且可定制的'Unknome數(shù)據(jù)庫(kù)'。

人類(lèi)基因組序列的粗略草案已經(jīng)有20年了。首次發(fā)布，包含數(shù)以萬(wàn)計(jì)的基因。

從那以后，我們學(xué)到了很多東西，先進(jìn)的技術(shù)像CRISPR一樣，但仍有數(shù)以萬(wàn)計(jì)的這些基因仍然是神秘的。

到目前為止，這些基因被科學(xué)忽視的原因有很多，分子生物學(xué)家Jo?o Rocha及其同事解釋說(shuō)。

它們包括資金和同行評(píng)審系統(tǒng)更傾向于支持對(duì)已經(jīng)證明具有臨床重要性的基因的研究，或者在實(shí)驗(yàn)室物種中更豐富或更廣泛的基因。

Unknome數(shù)據(jù)庫(kù)根據(jù)對(duì)蛋白質(zhì)基因的了解程度對(duì)蛋白質(zhì)基因進(jìn)行排名，這些蛋白質(zhì)基因適用于人類(lèi)和實(shí)驗(yàn)室環(huán)境中通常研究的其他物種。

為了證明如何使用這個(gè)數(shù)據(jù)庫(kù)，研究人員隨后采集了260個(gè)在數(shù)據(jù)庫(kù)中被列為高度未知的基因樣本，這些基因也可以在實(shí)驗(yàn)室蒼蠅中找到。果蠅基因組。

他們系統(tǒng)地刪除了發(fā)育中的蒼蠅的共同基因。許多蒼蠅沒(méi)有存活下來(lái)，這表明這些基因中的每一個(gè)編碼的蛋白質(zhì)在動(dòng)物生物學(xué)中起著至關(guān)重要的作用。

“這些未表征的基因不值得他們忽視，”說(shuō)分子生物學(xué)家肖恩·芒羅。

通過(guò)僅在某些組織中去除基因的表達(dá)，而不是在果蠅內(nèi)的其他組織中，研究人員能夠確定它們的一些功能。一些與男性生育能力、發(fā)育和壓力反應(yīng)相關(guān)的基因。

“通過(guò)識(shí)別問(wèn)題被無(wú)意和不合理地忽視的情況，有可能加速科學(xué)進(jìn)步，”該團(tuán)隊(duì)寫(xiě).

Rocha及其同事現(xiàn)在已經(jīng)確定了人類(lèi)基因組中那些被忽視的問(wèn)題，因此現(xiàn)在由世界各地的研究人員來(lái)幫助加速這一進(jìn)展。

“我們的數(shù)據(jù)庫(kù)提供了一個(gè)強(qiáng)大，多功能和高效的平臺(tái)，可以識(shí)別和選擇功能未知的重要基因進(jìn)行分析，從而加速縮小unknome所代表的生物學(xué)知識(shí)差距，”門(mén)羅總結(jié)道.

這項(xiàng)研究發(fā)表于公共科學(xué)圖書(shū)館生物學(xué).

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